新疆雙一流大學排名第一的是新疆大學，排名第二的是石河子大學，以下是具體排名情況，供大家參考。

1、新疆大學

新疆大學（XinjiangUniversity），簡稱“新大”，位于新疆維吾爾自治區首府烏魯木齊，是世界一流大學建設高校、全國重點大學、國家“211工程”重點建設高校、國家西部大開發重點建設高校、中西部高校基礎能力建設工程高校、中國政府獎學金來華留學生接收院校、國家建設高水平大學公派研究生項目高校、”卓越工程師教育培養計劃“高校、”卓越法律人才教育培養計劃“高校、教育部與新疆維吾爾自治區人民政府合作共建高校、中西部“一省一校”國家重點建設大學(Z14)聯盟成員、中國—中亞國家大學聯盟發起高校、全國深化創新創業教育改革示范高校。

新疆大學前身是創辦于1924年的新疆俄文法政專門學校。1935年1月改建為新疆學院，1960年10月1日，正式成立新疆大學，1978年被國務院確定為新疆唯一的全國重點大學，1997年被列入國家“211工程”，2000年被確定為國家西部大開發重點建設高校。2000年12月30日，新疆大學與原新疆工學院合并組建新的新疆大學。2004年，學校成為新疆維吾爾自治區人民政府、教育部“區部共建”高校。2017年6月，新疆大學被教育部列入國家“雙一流”建設戰略布局中42所“世界一流大學”建設之列。2018年，列入“部省合作共建高校”序列。

2、石河子大學

石河子大學（ShiheziUniversity），簡稱“石大”，位于新疆石河子市，由教育部和新疆生產建設兵團共建，是國家“世界一流學科建設高校”、部省合作共建高校、國家“211工程”重點建設高校、國家“中西部高校綜合實力提升工程”和“中西部高校基礎能力建設工程”高校，入選國家“2011計劃”、卓越醫生教育培養計劃、卓越工程師教育培養計劃、卓越農林人才教育培養計劃、國家建設高水平大學公派研究生項目、國家大學生創新性實驗計劃、國家級大學生創新創業訓練計劃、全國深化創新創業教育改革示范高校、中國政府獎學金來華留學生接收院校、國家大學生文化素質教育基地，國家西部重點建設十四所高校之一，為中西部高校聯盟成員。

石河子大學歷史淵源可追溯至1949年中國人民解放軍第一野戰軍創建的第一兵團衛生學校。1996年經教育部批準，隸屬農業部的原石河子醫學院、石河子農學院、兵團師范�？茖W校、兵團經濟�？茖W校合并組建石河子大學，所屬劃歸新疆生產建設兵團。